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發(fā)布時(shí)間:2015-10-19 瀏覽次數(shù):1332次
位于英國Colindale的中心公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室(CPHL)是英國醫(yī)學(xué)微生物學(xué)國家級的基準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室,而且是健康保護(hù)局(HPA)下屬的專家及基準(zhǔn)微生物部(SRMD)的一部分。CPHL承擔(dān)著為區(qū)域?qū)嶒?yàn)室,NHS醫(yī)院實(shí)驗(yàn)室,傳染病防治顧問,社區(qū)和醫(yī)院的醫(yī)生,環(huán)境衛(wèi)生人員,政府和行業(yè)顧問提供專業(yè)知識(shí)和建議的職責(zé)。
最近為期兩年的實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)實(shí)施工作在CPHL進(jìn)入到最后階段。該項(xiàng)目的主要目標(biāo)是提供一個(gè)成套的即用型系統(tǒng),結(jié)合部分定制開發(fā),以滿足CPHL實(shí)驗(yàn)室的需求。
CPHL由五個(gè)部門、9個(gè)實(shí)驗(yàn)室組成。此前已經(jīng)為四個(gè)實(shí)驗(yàn)室單獨(dú)開發(fā)Oracle系統(tǒng)管理實(shí)驗(yàn)室的數(shù)據(jù)。其他的實(shí)驗(yàn)室有的運(yùn)行自有的獨(dú)立系統(tǒng),或者完全沒有使用任何信息化系統(tǒng)。因此,迫切需要一個(gè)集成的實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)以高效地采集和處理病人和樣本的數(shù)據(jù)。系統(tǒng)還同時(shí)要考慮疾病暴發(fā)時(shí)的情況,以及與包括傳染病監(jiān)測中心(CDSC)在內(nèi)HPA其他分部共享數(shù)據(jù)的需要。系統(tǒng)需要提供傳染病在當(dāng)?shù)?,區(qū)域,國家和國際的流行報(bào)告,統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)和其他相關(guān)數(shù)據(jù)。管理信息還須提供關(guān)鍵績效指標(biāo)。
英國的Sysmex公司承接下了該合同。由于CPHL的工作性質(zhì)具有季節(jié)性變化的特點(diǎn),因此決定在2年多的時(shí)間里分步實(shí)施,而不是選擇一蹴而就的方法。
實(shí)施
實(shí)施過程劃分為五個(gè)階段開展,在試點(diǎn)單位正式上線之前,大部分定制化的功能都已經(jīng)完成。試點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室為免疫接種和診斷部,屬于腸道、呼吸道和神經(jīng)病毒實(shí)驗(yàn)室(ERNVL),于2003年1月開始試運(yùn)行。該單位每天處理100-150個(gè)樣本。其他實(shí)驗(yàn)室的上線日期與每個(gè)實(shí)驗(yàn)室主任商定,并考慮當(dāng)年所在的時(shí)間節(jié)點(diǎn),資源的可用性和實(shí)驗(yàn)室的方便性。這樣可以避免在實(shí)驗(yàn)室工作的繁忙時(shí)期實(shí)施系統(tǒng)從而給員工帶來過多的壓力。
項(xiàng)目全程由一個(gè)穩(wěn)定的項(xiàng)目小組進(jìn)行LIMS的實(shí)施。每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都至少派出一名代表擔(dān)任項(xiàng)目成員。這些工作人員成為該信息化項(xiàng)目組與最終用戶之間的溝通橋梁,同時(shí)他們對實(shí)驗(yàn)室的政策制度以及規(guī)程提出修改意見以最優(yōu)化系統(tǒng)運(yùn)行。項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)的成員接受了LIMS“超級用戶”的相關(guān)技術(shù)培訓(xùn),使他們能夠承擔(dān)部分的實(shí)施工作和應(yīng)對未來可能發(fā)生的變化,協(xié)助解答疑問,并提供內(nèi)部培訓(xùn)。因此,CPHL可以培養(yǎng)出具有專業(yè)知識(shí)的內(nèi)部人員來管理系統(tǒng),而不是僅僅依賴于供應(yīng)商。如今這個(gè)目的已經(jīng)非常圓滿地達(dá)到?,F(xiàn)在每一個(gè)實(shí)驗(yàn)室都有一名實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)的“超級用戶”,這些超級用戶十分熟悉他們的實(shí)驗(yàn)室的參數(shù)設(shè)置。
采用團(tuán)隊(duì)化的方法是項(xiàng)目成功的主要因素。還有的就是與最終用戶的有效溝通,多領(lǐng)域意見征集的決策過程。用戶接受度的被公認(rèn)為最大的潛在障礙之一。對于那些已經(jīng)使用原有的Oracle 系統(tǒng)10多年的用戶來說,使用習(xí)慣的轉(zhuǎn)變尤為具有挑戰(zhàn)性。為了促進(jìn)習(xí)慣的改變,實(shí)施過程中采用定期的團(tuán)隊(duì)會(huì)議,高頻次的功能郵件通報(bào),Demo演示和討論會(huì)議,使得工作人員逐步適應(yīng)新的變化。
CPHL很快就意識(shí)到有必要給項(xiàng)目組提供額外的資源以支持實(shí)施工作,包括用戶培訓(xùn)、管理制度和IT的輔助支持。試點(diǎn)單位上線以后,培訓(xùn)講師就開始培訓(xùn)所有其他最終用戶,并建立了一個(gè)資訊臺(tái)充當(dāng)LIMS支持團(tuán)隊(duì)和用戶之間溝通的橋梁。
現(xiàn)在CPHL的實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)有一個(gè)統(tǒng)一的LIMS系統(tǒng)(Sysmex MOLIS),并且加入了若干定制開發(fā)的應(yīng)用。它已在CPHL的八個(gè)實(shí)驗(yàn)室得到應(yīng)用,包括最后加入的性傳播感染與細(xì)菌實(shí)驗(yàn)室(STBRL)。該項(xiàng)目實(shí)現(xiàn)的主要好處是:改善了應(yīng)對工作請求的周轉(zhuǎn)時(shí)間; 更好地記錄疾病爆發(fā)數(shù)據(jù); 優(yōu)秀的樣本跟蹤; 提高了準(zhǔn)確度; 和實(shí)時(shí)的統(tǒng)計(jì)整個(gè)CPHL的數(shù)據(jù)。
無紙化的微生物實(shí)驗(yàn)室
該項(xiàng)目已經(jīng)給實(shí)驗(yàn)室?guī)砹藰I(yè)務(wù)流程上的改變。實(shí)驗(yàn)室接收的大量樣品已經(jīng)合理轉(zhuǎn)移到到中心樣本接收機(jī)構(gòu),每天大約800個(gè)樣本(包括參考和監(jiān)控)的接收采用無紙化的工作方式接收。
由于申請表在樣本注冊時(shí)就已經(jīng)掃描入庫,因此可在流程中的每一個(gè)節(jié)點(diǎn)上在屏幕上查看具體的申請信息。 系統(tǒng)一個(gè)主要的優(yōu)點(diǎn)是,它允許根據(jù)各個(gè)實(shí)驗(yàn)室的具體需求采集更多的數(shù)據(jù),如免疫接種日期和MMR監(jiān)督工作的更多細(xì)節(jié),旅行史,為腸胃炎測試的抗菌治療。
該系統(tǒng)可以幫助實(shí)驗(yàn)室工作人員執(zhí)行日常任務(wù),并幫助對微生物測試的不同步驟做出決定。每個(gè)單獨(dú)的工作步驟,測試結(jié)果和用戶信息詳細(xì)地記錄在電子表格中。這些結(jié)構(gòu)化的和可搜索的工作表可以采用樹形結(jié)構(gòu)折疊和展開。在實(shí)施過程中,該小組已確定約230個(gè)不同類型的樣本以及1100種測試選項(xiàng)。一個(gè)綜合性醫(yī)院類型微生物學(xué)部門使用MOLIS大約有200步。CPHL在微生物學(xué)工作區(qū)管理器(Microbiology Work Area Manager)中定義了3750個(gè)不同的步驟和15000個(gè)不同的結(jié)果代碼。精心設(shè)計(jì)的邏輯編碼簡化搜索,數(shù)據(jù)輸入過程中避免歧義。通過連接相對“沉默”的設(shè)備,這套新系統(tǒng)相比以前提供了更大程度的自動(dòng)化。在性傳播和血源性病毒實(shí)驗(yàn)室(SBVL),結(jié)果的自動(dòng)下載特別節(jié)省時(shí)間。除了酶標(biāo)儀接口,Sysmex也與CDSC監(jiān)控系統(tǒng)Labbase2做了整合。
由于CPHL監(jiān)測和研究工作的性質(zhì),樣品跟蹤和存檔成為建立LIMS的重要出發(fā)點(diǎn)。每個(gè)樣本,分裝單元和培養(yǎng)基都貼上了條形碼,從登記入庫到歸檔都可以跟蹤。歸檔功能可以對放置在冰箱或培養(yǎng)庫中的樣品進(jìn)行跟蹤和定位以進(jìn)行進(jìn)一步的測試。CPHL各個(gè)層面廣泛使用了MOLIS規(guī)則庫和決策表,例如噬菌體類型衍化和樣品路徑。無紙化環(huán)境的其他功能還包括標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)驗(yàn)室報(bào)告生成,以及新開發(fā)的疾病爆發(fā)模塊。
CPHL變化頻繁的工作性質(zhì)和新測試方法的不斷發(fā)展,客觀上要求MOLIS能夠快速修改和增加測試和代碼而不影響日常工作或者損害歷史數(shù)據(jù)。這在2003年SARS暴發(fā)時(shí)表現(xiàn)得尤為引人注目,當(dāng)時(shí)需要在剛實(shí)施的ERNVL模塊中快速添加一個(gè)全新的試驗(yàn)組。令人欣喜的是,包括測試項(xiàng)目,特定人群,結(jié)果代碼,工作列表和樣品路徑等工作都是由CPHL的人員自行建立的,而非供應(yīng)商Sysmex的工作人員。
未來計(jì)劃
從試點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的上線,到所有實(shí)驗(yàn)室在1月份全部上線,組織和員工之間建立了十分良好互信關(guān)系。項(xiàng)目按時(shí)完成并且沒有超出預(yù)算,該項(xiàng)目被各方看作是一個(gè)巨大的成功。最初的合作方式已被證明是取得這一成果的關(guān)鍵因素。更高層次的信任也催生出一些額外的項(xiàng)目成果。